罗切斯特理工学院的科学家们发现了有关冠状病毒及其几种变体附着在人体细胞上方式的新信息。最近发表在《生物分子结构与动力学》杂志上的一项研究揭示了这一发现。
研究人员使用由托马斯·h·戈斯内尔生命科学学院副教授格雷戈里·巴比特开发的代码来研究冠状病毒如何利用它们的刺突蛋白将自己附着在它们所攻击的宿主细胞上。
“我们在分子动力学领域使用复杂的计算机模拟来比较β冠状病毒蛋白与宿主细胞的第一次相互作用,”20岁(生物信息学和计算生物学)、21岁(生物信息学)硕士(生物信息学)帕特里克·林凯维奇说,他是这项研究的带头人。“这是病毒刺突蛋白(即所谓的受体结合域)和人类宿主细胞受体ACE2之间的相互作用。”
研究人员研究了SARS-CoV-2和α、β和γ变体,以及在人类和蝙蝠中发现的几种地方性冠状病毒株。作者发现,冠状病毒在两个主要位置捕获人类细胞,随着它进化成新的变体,它对人类目标的控制正在加强。
该研究的作者还包括来自Hauptman-Woodward医学研究所的研究员Miranda Lynch和RIT理学院的教授andr
Hudson和副教授Feng Cui,他们希望这些发现可以帮助指导未来药物的设计,并帮助预测未来的变异如何进化并感染人类。
五年前,在数学科学学院教授Ernest Fokoue和几名生物医学工程专业学生的帮助下,Babbitt最初开发了将机器学习应用于这些复杂模拟输出的代码。然而,直到Rynkiewicz在大流行的早期阶段提出这个想法,他才想到用这种代码来研究冠状病毒。
春季毕业后,Rynkiewicz在Regeneron制药公司找到了一份生物信息学开发助理的工作,负责代码开发、管道开发和自动化,以帮助公司安全生产药物。他仍然与巴比特保持联系,两人还讨论过在未来的论文中合作。目前,巴比特正在用他的代码研究病毒的变种。