
圣路易斯华盛顿大学医学院的研究人员创建了一个庞大的在线数据库,将数千个与癌症和其他疾病相关的基因与针对这些基因的药物进行匹配。其中一些药物已获得美国食品和药物管理局的批准,而其他药物正在进行临床试验或刚刚进入药物开发管道。
该数据库是由同卵双胞胎兄弟欧比·格里菲斯博士和玛拉基·格里菲斯博士开发的,他们对药物与基因配对的兴趣既是科学的,也是个人的。他们的母亲17年前死于乳腺癌,就在他们高中毕业前几周。
遗传学研究讲师玛拉基·格里菲斯(Malachi Griffith)解释说:“我们希望创建一个用户友好的综合数据库,类似于谷歌疾病基因搜索引擎。”“随着我们向个性化医疗迈进,人们对了解药物是否可以针对特定患者或某些疾病(如乳腺癌或肺癌)的突变基因很感兴趣。但一直没有一种简单的方法来找到这些信息。”
药物基因相互作用数据库的详细信息将于10月13日在线报道。该数据库以癌症基因为主,但也包括与阿尔茨海默病、心脏病、糖尿病和许多其他疾病有关的基因。格里菲思夫妇和圣路易斯华盛顿大学基因组研究所的一组科学家一起创建了这个数据库。
这个数据库很容易搜索,并且面向那些想知道疾病基因错误(通过基因组测序或其他方法确定)是否有可能被现有药物治疗靶向的研究人员和内科科学家。数据库中包含的其他基因可能是未来药物开发工作的重点,因为它们属于被认为有希望成为药物靶点的基因类别。
“开发数据库对格里菲思夫妇来说是一项热爱的工作,”资深作者、基因组研究所主任理查德·k·威尔逊博士说。“这一资源具有惊人的深度,这对研究人员为患者设计更好的治疗方案将是无价的。”
Wilson和他的同事们提醒说,这个数据库是用于研究目的的,它并不推荐治疗方法。该数据库的主要目的是促进旨在更有效地治疗疾病的临床研究。
“这个数据库让我们离这个目标更近了一步,”玛拉基·格里菲斯说。“这是一个非常丰富的资源,我们很高兴能把它提供给科学界。”
该数据库花了数年时间开发,现已公开并免费使用。它包括超过14,000种药物-基因相互作用,涉及2,600个基因和6,300种针对这些基因的药物。数据库中还有另外6700个基因,因为它们可能成为未来药物的目标。
在此之前,想要找出疾病基因是否可以被药物靶向的研究人员不得不在科学文献、临床试验数据库或其他信息来源中零碎地搜索,其中一些信息是不公开的,也不容易搜索。此外,许多现有的数据库都有不同的方法来识别基因和药物,这是一个“语言”障碍,可以把一个明确的搜索变成一个详尽的练习。
格里菲斯兄弟是生物信息学方面的专家。生物信息学是一门融合了生物学和计算机的科学领域,涉及对大量数据的分析。在多次被问及通过癌症基因组测序确定的基因列表是否可以被现有药物靶向后,兄弟俩产生了建立药物-基因相互作用数据库的想法。
医学研究助理教授欧比·格里菲斯(Obi Griffith)说:“这个问题不需要电脑奇才才能回答。”“但在现实中,我们常常不得不编写专门的软件来找出答案。现在,研究人员可以快速方便地搜索自己。”
新的数据库汇集了来自美国、加拿大、欧洲和亚洲15个公开数据库的信息。用户可以输入单个基因的名称或许多基因的列表来检索针对这些基因的药物。搜索提供针对每个基因的药物名称,以及药物是抑制剂、抗体、疫苗还是其他类型的详细信息。搜索结果还会显示信息的来源,如果用户愿意,他们可以更深入地挖掘。
资料来源:圣路易斯华盛顿大学医学院



