“我们有大约10张图片,我们花了整整10个月的时间来理解它们,”德弗拉明克说。
对于每张图像,研究人员对数亿个DNA分子进行测序,然后将它们翻译成基因表达矩阵。每个像素包含小鼠基因组中所有22,000个蛋白质编码基因的表达水平。乘以大约100,000像素。而这仅仅是个开始。
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“你必须将这些数据转化为生物学发现,观察时间模式,找出特殊的细胞状态等等,”德弗拉明克说。“它不像普通的显微镜图像,你有图像,就是这样,你看到你看到的。”
这个急性过程以前从未被发现过,当它出错时,可能会导致排卵率降低,并可能阻碍生育。研究人员还能够检测到早期分化标记,这些标记决定了细胞在卵巢中的不同路径。实际上,图谱捕获了排卵早期和晚期的动态细胞和分子控制程序。
德弗拉明克说:“这种类型的图谱提供了更多关于卵巢中所有分子变化发生的地点和时间的细节,这些细节很难用其他方法捕捉到。”“因此,这可能会激发针对我们识别的特定分子的新干预措施,例如,对生育管理很重要的特定基因。”
现在,德弗拉明克和任都是康奈尔生殖科学中心的教员,他们计划扩大合作,探索与肥胖和生殖衰老相关的生育和排卵问题。
研究人员指出,仅在美国,超过10%的不孕症病例是由排卵失败引起的,而肥胖和母亲年龄的增加加剧了这一问题。
德·弗拉明克说:“康奈尔大学对这类问题的兴趣越来越大,我们可以在生殖医学中使用尖端的工程原理——在这个领域,这些尖端的工具没有像在其他一些领域,比如癌症生物学中那样被使用得那么多或那么早。”
Source-Eurekalert