牛津大学出版社发表在《生物学方法与方案》上的一篇新论文表明，有可能设计出对感染病原体(如导致COVID-19的病毒)产生更强免疫反应的疫苗。在这项研究中，作者提出并测试了一种新的生物信息学方法和工具，使研究人员能够选择引起强烈免疫反应的蛋白质部分。基于这种方法开发的疫苗将提供更好的疾病保护。

　　人类(和其他脊椎动物)的免疫系统区分自我和非自我结构来攻击和摧毁后者。T细胞是免疫系统中负责这种识别的部分。他们通过识别存在于非自身蛋白质(例如病毒或细菌的蛋白质)中，但不存在于宿主蛋白质(例如人类的蛋白质)中的短链氨基酸来实现这一目标。

　　为了避免被宿主的T细胞识别，寄生生物从它们的蛋白质中清除所有不必要的肽。特别是，它们使这些肽发生突变，以模仿宿主物种的蛋白质中存在的肽。

　　在这项研究中，研究人员测试了肽模仿理论的一个关键预测:他们研究了是否可以根据宿主体内缺失的肽含量来预测寄生虫蛋白质引发免疫反应的能力。在早期详细绘制与SARS-CoV-2相关的t细胞克隆图谱的基础上，他们探索了实际t细胞应答靶标列表和潜在t细胞识别靶标列表之间的交叉点，这些靶标存在于SARS-CoV-2中，但在人体中不存在。

　　计算机模拟表明，实际的t细胞识别目标具有明显更高比例的五肽和六肽(肽分别由五个和六个氨基酸组成)，而不是在人类蛋白质中发现的。这种基于免疫学理论的新方法在检测SARS-CoV-2目标方面的效率是目前基于经验观察的方法的四倍。

　　这组作者认为，这种方法将使研究人员能够开发出更有效的疫苗，专门用于识别和靶向寄生虫中触发最强免疫反应的蛋白质部分。

　　该论文的第一作者雅罗斯拉夫·弗莱格说:“我们的肽模仿理论主要是作为一项基础研究努力开始的，该理论研究了寄生虫如何使其肽词汇适应宿主的肽词汇。”

　　“然而，当我们探索这个话题时，我们发现它也可能具有广泛的实际意义，例如在疫苗构建领域。我们希望我们的发现将加深我们对疾病进化和病原体传播的理解，并为加强疫苗设计和更广泛地抗击传染病提供有价值的见解。”

　　更多信息:Jaroslav Flegr等，揭露和利用SARS-CoV-2宿主-寄生虫军备竞赛线索:一种改进t细胞免疫原性预测的主要新方法，生物学方法与方案(2023)。DOI: 10.1093/biomethods/bpad011, academic.oup.com/biomethods/ar . 3/biomethods/bpad011由牛津大学出版社提供引用:研究提出了新的生物信息学方法来设计更好的疫苗(2023年，7月25日)2023年7月25日检索自https://medicalxpress.com/news/2023-07-bioinformatic-approach-vaccines.html本文档受版权保护。除为私人学习或研究目的而进行的任何公平交易外，未经书面许可，不得转载任何部分。内容仅供参考之用。